ワインの乳酸菌の特性評価および選択における多相性のアプローチ

微生物学博士論文。この作品は、マロラクティック発酵(MLF)を実施するための細菌培養「スターター」の選択の複雑な問題の範囲内にあります。これに関連して、仕事が自生株を選択する目的で、自発的MLFを被っドウロ地域(RDD)、の赤ワインから分離した乳酸菌(LAB)のコレクションの表形分類のと機能的特徴から成っそれらは、より優れた醸造プロセスに適合した「スターター」として使用することができます。多相アプローチでは、グループ化戦略や株、表現型および分子的方法の順次選択に応じてBALコレクションの表形分類の多様性を評価するために適用され、ためたこの多様性と活動のプロファイルの分離株の代表のサブセットの特徴づけenological関心の酵素。この作業の過程で、それは、3つの連続したヴィンテージ(1999年から2001年)でRDDの18ワイナリーに集めたワインの193サンプルから793 BALのコレクションを単離しました。この属に属する分離株の90.6パーセントで支配的な属Oenococcusは、6.2%が3.2%にラクトバチルス属およびペディオコッカスに所属しました。無作為に選択された研究の分離株の数を減らすために、295のサンプルは、元のコレクションの代表を分離します。特徴付けは、これらの株は、高い類似度を持つクラスタ」の定義とその下にある多様性の代表的な菌株を選択する(全細胞タンパク質プロファイルおよびM13-PCR「フィンガープリント」の分析)タイピングの化学分類と分子法を適用した表形分類学。総細胞タンパク質プロファイルの分析の結果、PCR-M13「フィンガープリント」で単離されたゲノムタイピング227のために選択しました。これらの「フィンガープリント」プロファイルの分析によると、可能であった隔離する16S rDNAの解析により、種レベルを識別するために、コレクションの表形分類の多様性の96の代表株を選択します。これらの株の16S-ARDRAプロファイルの分析は、16S rDNAの配列決定のために代表者の17 restritiposの同定および選択を可能にしました。種レベルの同定は、利用可能なデータベースから入手し、分析結果と統合部分配列と比較することによって行った16S-ARDRAを。BALから単離した295は、以下の種Oenococcus oeni(227)において同定されました。ロイコノストックmesenteroides(2); ラクトバチルス・マリ(19)。ラクトバチルス・ブレビス(11)。ラクトバチルス・プランタラム/